Het TIR-carnet kan worden gebruikt voor een transport dat gedeeltelijk niet over de weg plaatsvindt zoals over water of per spoor. De werking van het TIR-carnet wordt tijdens het transport over water of per spoor opgeschort. Controle van het TIR-carnet vangt opnieuw aan op het eerste douanekantoor waar de TIR operatie over de weg wordt voortgezet.